Orixinalmente concibíronse como parte da alquimia ou protociencia (preciencia), que máis tarde evolucionou cara á química. Ata o século XVIII utilizáronse os símbolos mencionados para designar determinados elementos e compostos. Os símbolos variaban lixeiramente nas marcas dos alquimistas, polo que os que coñecemos ata hoxe son froito da estandarización destas marcas.
Segundo Paracelso, estes signos coñécense como os tres primeiros:
sal - que indica a base da substancia - marcado en forma de círculo cun diámetro horizontal claramente marcado,
O mercurio, que significa o enlace líquido entre o alto e o baixo, é un círculo cun semicírculo na parte superior e unha cruz na parte inferior.
xofre - o espírito da vida - un triángulo conectado por unha cruz.
Os seguintes son os símbolos dos elementos da terra, todos en forma de triángulos:
Metais marcados con símbolos de planetas e corpos celestes:
Os símbolos alquímicos tamén inclúen:
Ouroboros é unha serpe que come a súa propia cola; en alquimia, simboliza un proceso metabólico en constante renovación; é o xemelgo da pedra filosofal.
Heptagrama - significa os sete planetas coñecidos polos alquimistas na antigüidade; os seus símbolos móstranse arriba.